高通量性： 基因测序系统能够同时测序数百万到数十亿条DNA或RNA片段，实现高通量测序。这种高通量性使得研究人员可以快速、准确地获取大量的基因组信息。

高灵敏度： 基因测序系统能够检测到基因组中极低浓度的DNA或RNA，具有高灵敏度。这使得基因测序系统在检测罕见突变、低频变异或微生物种群结构等方面具有重要应用。

高分辨率： 基因测序系统能够提供单个碱基的分辨率，可以准确地确定DNA或RNA序列中的每一个碱基。这种高分辨率使得基因测序系统在基因型鉴定、基因组组装等方面具有优势。

多样性： 基因测序系统具有多样的测序技术和平台选择，如Sanger测序、Illumina测序、PacBio测序等，可以满足不同研究需求的测序深度、覆盖度和成本要求。

全基因组覆盖： 基因测序系统可以实现对整个基因组的测序，包括编码区域、非编码区域、重复序列等。这种全基因组覆盖性使得研究人员可以全面了解基因组的信息。

个性化医疗： 基因测序系统可以为个体提供个性化的基因组信息，用于疾病风险评估、药物反应预测、遗传疾病诊断等个性化医疗应用。

快速性： 部分基因测序系统能够在较短的时间内完成测序实验和数据分析，提供快速的结果。这种快速性对于急诊诊断、流行病学调查等应用具有重要意义。